BIO-INFORMATICIEN / BIOINFORMATICIAN

Description du poste

INSTITUT DE RECHERCHE DU CUSM / RESEARCH INSTITUTE OF THE MUHC

SOMMAIRE DU POSTE
L’institut de recherche du CUSM (IR-CUSM) offre un poste de bioinformaticien à un candidat très compétent et motivé afin d’aider au développement de la plateforme de bio-informatique dédiée à la génomique translationnelle et appliquée. Le titulaire du poste participera à la conception, au développement, au déploiement et au maintien de systèmes informatiques et des outils nécessaires à l’analyse et à l’interprétation de données génomiques. Il fournira également un soutien technique et scientifique aux chercheurs de l’IR-CUSM et participera aux activités de formation.

FONCTIONS ET ATTRIBUTIONS
• Développer, déployer et maintenir des pipelines d'analyse de données de séquençage nouvelle génération (WES, WGS, ARN-Seq, ChIP-Seq, etc.).
• Développer et maintenir des applications web pour l’intégration et la visualisation de données génomiques.
• Aider aux opérations quotidiennes de la plateforme, incluant l'analyse de données et la communication avec les utilisateurs.
• Fournir un support technique pour les questions et les problèmes informatiques des utilisateurs.
• Élaborer du matériel de formation et rédiger de la documentation.
• Participer à la rédaction d’articles scientifiques et de demandes de financement.

CONDITIONS DE TRAVAIL
Statut : Temporaire, Temps complet.
Échelle de rémunération : Selon les qualifications et l’expérience.
Site de travail : Site Glen (1001 Boulevard Décarie)

Note : Dans le but d'alléger le texte, le genre masculin inclut le féminin.

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POSITION SUMMARY
The Research Institute of the MUHC (RI-MUHC) is looking for a highly motivated and skilled Computational Biologist/ Bioinformatician to contribute to the development of the bioinformatics platform in translational and medical genomics. Under the direction of the platform manager, the post-holder will participate in the design, development, implementation and maintenance of information systems and tools for managing, analyzing and interpreting genomic data. The post-holder will also provide expert consultation, technical, and scientific support for investigators of the RI-MUHC, and assist in training activities.

GENERAL DUTIES
• Develop, implement and maintain analytical pipelines for next-generation sequencing data analysis (WES, WGS, RNA-Seq, ChIP-Seq, etc.).
• Design and maintain web-based tools for data integration and visualization.
• Assist with day-to-day platform operations, including data analysis and communication with service users.
• Provide IT support for user questions and problems.
• Develop training materials and documentation.
• Participate in article and grant writing.

WORKING CONDITIONS
Status: Temporary, Full-time.
Pay Scale: According to qualifications and experience.
Work Site : Glen site (1001 Boulevard Decarie).

NOTE: The masculine gender has been used for brevity and includes the feminine gender.

Exigences

• MSc ou PhD en bioinformatique, biologie computationnelle ou génie informatique.
• Au moins deux ans d’expérience de travail en bio-informatique.
• Excellente maîtrise de Linux, python, bash et git.
• Expérience avérée en analyse de données de séquençage nouvelle génération.
• Expérience dans le développement d’applications web.
• Expérience dans la conception de bases de données relationnelles.
• Excellentes compétences de communication en français et en anglais (parlé et écrit).
• Expériences en développement java et en analyses protéomiques peut être un atout.

LE POSTE AFFICHÉ N’EST PAS UN POSTE D’HÔPITAL

L'Institut de recherche du CUSM encourage l'équité en matière d'emploi.

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• MSc. or Ph.D. in bioinformatics, computational biology or computer sciences.
• At least two years of work experience in bioinformatics.
• Proficient in Linux, python, bash and git.
• Strong working experience in analyzing next-generation sequencing data.
• Experience in web-based software development.
• Experience in designing relational databases.
• Strong communication skills in both French and English (spoken and written).
• Experience in java development and in proteomics analysis can be an asset.

THIS IS NOT A HOSPITAL POSITION.

The Research Institute of the MUHC encourages equity in employment.

Description de l'organisation

"L'Institut de recherche du Centre universitaire de santé McGill (IR-CUSM) est un centre de recherche de réputation mondiale dans le domaine des sciences biomédicales et des soins de santé. Établi à Montréal, au Québec, l'Institut constitue la base de recherche du Centre universitaire de santé McGill (CUSM), centre hospitalier universitaire affilié à la Faculté de médecine de l'Université McGill. L'IR-CUSM est financé en partie par le Fonds de recherche du Québec - Santé (FRQS)."